Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/20.500.13091/2192
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.authorSevimoğlu, Tuba-
dc.date.accessioned2022-02-26T20:58:19Z-
dc.date.available2022-02-26T20:58:19Z-
dc.date.issued2021-
dc.identifier.issn2667-8055-
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.36306/konjes.800688-
dc.identifier.urihttps://dergipark.org.tr/tr/pub/konjes/issue/62624/800688-
dc.identifier.urihttps://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/1311911-
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.13091/2192-
dc.descriptionDergiPark: 800688en_US
dc.descriptionkonjesen_US
dc.description.abstractBehçet Hastalığı, vücutta kan damarı iltihabına neden olan ve tüm organ sistemlerini etkileyebilen nadir bir oto enflamatuar ve otoimmün hastalıktır. Hastalığın patofizyolojisi halen araştırılmaktadır.Semptomlar değişkenlik gösterdiği için teşhis edilmesi zordur ve hastalık için yeterli tıbbi tedavi yoktur.Bu çalışmada Behçet Hastalığı gen (izole edilmiş CD4 + T hücreleri ve CD14 + monositlerinden örnekler) ve miRNA ekspresyonu (trombosit içermeyen plazmadan örnekler) veri setleri istatistiksel olarak analiz edilmiştir. CD4 + T hücreleri ve CD14 + monositleri için farklı şekilde ifade edilen genler tanımlanmış ve bu verilerle ilişkili miRNA listelenmiştir. Protein-protein ve miRNA - hedef gen etkileşim ağları oluşturulmuş ve bu ağların merkezi olanları her iki hücre tipi için belirlenmiştir. Gen ekspresyon verileri ile ilişkili metabolitler ve metabolik yollar ortaya konulmuş ve ilişkili sinyal yollarını ve hastalıklarını tanımlamak için zenginleştirme analizi yapılmıştır. Trombosit içermeyen plazma örneklerinin farklı olarak ifade edilen miRNA'ları da tanımlanmıştır. Analiz sonuçları, hücre/doku tipine bağlı genomik yeniden programlamayı göstermiştir. Tüm hücre/doku türlerinde merkezi miRNAlar (hsa-miR-17-5p, hsa-miR-603, hsa-miR-375, hsa-miR-107, hsa-miR-454-3p, hsa-miR-650, hsa-miR-142-3p and hsa-miR-765) ve CD4 + ve CD14 + hücreleri için metabolitler (guanidinoasetat ve histon-L-lizin) biyobelirteç adayları olarak belirlenmiştir. Gelecekte yapılacak olan ve bu aday biyobelirteçlere odaklanan deneysel çalışmalar ile bir teşhis kiti veya geliştirilmiş terapötiklerin tasarımı gerçekleştirilebilir.en_US
dc.description.abstractBehcet’s Disease is a rare auto inflammatory and autoimmune disorder that causes blood vessel inflammation throughout the body and can affect all organ systems. The pathophysiology of the disease is still under investigation. Since the symptoms are varying it is difficult to diagnose and there are no sufficient medical treatments for the disease. In this study Behcet’s Disease gene (Samples from isolated CD4+ T cells and CD14+ monocytes) and miRNA expression (samples from platelet free plasma) datasets were statistically analyzed. Differentially expressed genes for CD4+ T cells and CD14+ monocytes have been identified and miRNA associated with this data were listed. Protein-protein and miRNA – target gene interaction networks were constructed and hubs of these networks were identified for both cell types.Metabolites and metabolic pathways associated with gene expression data were displayed and enrichment analysis was done to identify associated signaling pathways and diseases. Differentially expressed miRNAs of platelet free plasma samples were also identified. The analysis results indicated cell/tissue type dependent genomic reprogramming. Mutual hub miRNAs (hsa-miR-17-5p, hsa-miR-603, hsa-miR- 375, hsa-miR-107, hsa-miR-454-3p, hsa-miR-650, hsa-miR-142-3p and hsa-miR-765) in all cell/tissue types and metabolites (guanidinoacetate and histone-L-lysine) for CD4+ and CD14+ cells may be considered as biomarker candidates. Future studies focusing on these candidate biomarkers might yield a diagnostic kit or design of enhanced therapeutics for Behcet’s Disease.en_US
dc.language.isotren_US
dc.publisherKonya Technical Universityen_US
dc.relation.ispartofKonya Mühendislik Bilimleri Dergisien_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectBehçet Hastalığıen_US
dc.subjectgen ifadesien_US
dc.subjectmiRNAen_US
dc.subjectetkileşim ağlarıen_US
dc.subjectmetabolitleren_US
dc.subjectBehcet’s Diseaseen_US
dc.subjectgene expressionen_US
dc.subjectmiRNAen_US
dc.subjectinteraction networksen_US
dc.subjectmetabolitesen_US
dc.titleBütünleştirici Analiz Kullanarak Behçet Hastalığında Biyobelirteç Adayları Belirlenmesien_US
dc.title.alternativeBIOMARKER CANDIDATES IDENTIFIED IN BEHCET’S DISEASE USING INTEGRATIVE ANALYSISen_US
dc.typeArticleen_US
dc.identifier.doi10.36306/konjes.800688-
dc.departmentKTÜNen_US
dc.identifier.volume9en_US
dc.identifier.issue2en_US
dc.identifier.startpage479en_US
dc.identifier.endpage489en_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Başka Kurum Yazarıen_US
item.openairetypeArticle-
item.languageiso639-1tr-
item.cerifentitytypePublications-
item.grantfulltextopen-
item.fulltextWith Fulltext-
item.openairecristypehttp://purl.org/coar/resource_type/c_18cf-
Appears in Collections:Konya Mühendislik Bilimleri Dergisi
Files in This Item:
File SizeFormat 
10.36306-konjes.800688-1311911.pdf584.09 kBAdobe PDFView/Open
Show simple item record



CORE Recommender

Page view(s)

1,096
checked on Mar 25, 2024

Download(s)

66
checked on Mar 25, 2024

Google ScholarTM

Check




Altmetric


Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.